インストール後、日本語公式サイトにも載っているが
デフォルトで.htaccessで制限されてるが以下3つのディレクトリをドキュメントルート外へ移動させる
・data ページデータや画像ファイルなど
・conf 設定ファイル
・bin コマンドラインツール
※binフォルダはシェル等で作業しないならフォルダごと削除しても問題無し
移動作業
/home/yourname/dokuwiki/
上記の様にpublic_htmlと同階層にフォルダを作ると管理しやすい
・dataディレクトリ
dokuwikiフォルダ内に、dataフォルダを移動させる
移動元フォルダ：
/home/yourname/public_html/dokuwiki/data/
移動先フォルダ：
/home/yourname/dokuwiki/data/
移動させると管理画面がエラーになるので設定ファイルに以下を記述する
/home/yourname/public_html/dokuwiki/conf/local.php
$conf['savedir'] = '/home/yourname/dokuwiki/data/';
・confディレクトリ
dataフォルダと同様にフォルダを移動させる
移動元フォルダ：
/home/yourname/public_html/dokuwiki/conf/
移動先フォルダ：
/home/yourname/dokuwiki/conf/
confは以下のファイルを修正する
/home/yourname/public_html/dokuwiki/inc/preload.php
上記ファイルが無い場合は、preload.php.distからコピーする
define('DOKU_CONF','/home/yourname/dokuwiki/conf/');
・binディレクトリ
フォルダ移動のみ
移動元フォルダ：
/home/yourname/public_html/dokuwiki/bin/
移動先フォルダ：
/home/yourname/dokuwiki/bin/